La tolérance périphérique est acquise par délétion clonale ou par anergie.
L’anergie est un état de non-réponse spécifique induit dans un lymphocyte T par une stimulation antigénique non accompagnée des signaux de costimulation délivrés par certaines molécules membranaires des cellules présentatrices d'antigènes (CD80, CD86).
La rougeole ou le SIDA peuvent provoquer une anergie trompeuse.