Le neurotransmetteur endogène du système sympathique est la noradrénaline et celui du système parasympathique est l’acétylcholine.
Le système sympathique autonome, — orthosympathique ou sympathique proprement dit et parasympathique ou vague, — en dépit des liaisons qu’il soutient avec le système neuro-cérébral, a cependant ses fonctions propres.